신진연구자 소개

백 민 경 Minkyung Baek

서울대학교 생명과학부, 조교수

minkbaek@snu.ac.kr, https://biosci.snu.ac.kr/cssb

■ 서울대학교 화학부, 학사(2009. 3 - 2013. 2)

■ 서울대학교 화학부, 박사(2013. 3 - 2018. 8, 지도교수 : 석차옥)

■ 서울대학교 화학부, 박사 후 연구원(2018. 9 - 2019 .3, 지도교수: 석차옥)

■ University of Washington, 박사 후 연구원(2019. 5 - 2022. 7, 지도교수 : David Baker)

■ 서울대학교 생명과학부, 조교수(2022. 9 - 현재)

소개글

백민경 교수는 컴퓨터 계산을 통한 생체분자의 구조 및 상호작용을 예측하는 연구를 수행해왔다. 백민경 교수가 개발한 단백질 구조 예측 인공지능인 RoseTTAFold는 2021년 Science 저널의 올해의 혁신 연구로 선정된 바 있다. 최근에는 단백질 구조 예측 인공지능을 확장하여 단백질과 핵산을 비롯한 다양한 생체분자 구조 및 상호작용을 예측하고, 이를 기반으로 새로운 기능을 가지는 단백질을 디자인하는 인공지능 방법 개발 연구를 활발히 수행하고 있다.

주요연구분야

• 계산생물학(Computational Chemistry)

• 물리화학(Physical Chemistry)

• 생체분자 구조 모델링(Biomolecular structure modeling)

• 단백질 디자인(Protein design)

대표논문

1. M. Baek, R. McHugh, I. Anishchenko, H. Jiang, D. Baker, F. DiMaio, “Accurate prediction of protein-nucleic acid complexes using RoseTTAFoldNA”, Nature Methods 2024, 21, 117–121.

2. I. R. Humphreys*, J. Pei*, M. Baek*, A. Krishnakumar*, et al, “Computed structures of core eukaryotic protein complexes”, Science, 2021, 374 (6573), eabm4805.(*co-first authors).

3. M. Baek, I. Anishchenko, H. Park, I. R. Humphreys, D. Baker, “Protein oligomer modeling guided by predicted inter-chain contacts in CASP14”, Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 2021, 89(12), 1824-1833.

4. I. Anishchenko*, M. Baek*, H. Park*, et al., “Protein tertiary structure prediction and refinement using deep learning and Rosetta in CASP14”, Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 2021, 89(12), 1722-1733(*co-first authors).

5. J. L. Watson, D. Juergens, N. R. Bennett, (M. Baek), et al., “De novo design of protein structure and function with RFdiffusion”, Nature 2023, 620, 1089-1100.

6. M. Baek, T. Park, H. Woo, and C. Seok*, Prediction of Protein Oligomer Structures using GALAXY in CASP13, Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 2019, 87(12), 1233-1240.

7. M. Baek, W. -H. Shin, H. W. Chung, and C. Seok*, GalaxyDock BP2 Score: A Hybrid Scoring Function for Accurate Protein-Ligand Docking, Journal of Computer-Aided Molecular Design 2017, 31(7), 653-666.

8. M. Baek, T. Park, L. Heo, C. Park, and C. Seok*, GalaxyHomomer: A web server for protein homo-oligomer structure prediction from a monomer sequence or structure, Nucleic Acids Research 2017, 45(W1), W320 - W324.